近日,湖北省疾控中心成功完成新型冠狀病毒分離與全基因組測序工作,獲得病毒全基因組序列,全長29847bp。
記者了解到,有了新型冠狀病毒全基因組序列,意味著拿到病毒的完整“大數據”,病毒如何生長,在傳播過程中是否變異,都能進行動態監測。
霍細香的工作照(鴨舌帽)
獲得病毒全基因組序列有多重要
檢測試劑盒的研發和抗病毒藥物的開發都需要依托對病毒的全面、深入了解,一旦病毒的基因發生變異,試劑盒也需要根據基因的變異情況進行優化和調整。病毒全基因組序列還能為醫藥企業提供依據,來尋找抗病毒藥物突破的靶點。
1月31日,記者來到省疾控中心,衛生檢驗檢測研究所的工作人員們正在實驗室里忙碌,副所長霍細香介紹,檢驗所承擔著新型冠狀病毒的檢測、研究工作,包括病例確診、病毒溯源、全基因組序列測定與分析,既要為醫護人員的救治提供依據,也是為抗原的制備和疫苗研發做準備。
記者了解到,檢驗所下設的生物安全三級(俗稱P3)實驗室,是全國疾控系統中第六家有相應資質的P3實驗室,于2008年經過資質認可,2009年開始,針對甲型H1N1流感病毒進行病毒檢測、培養等工作,此后,還針對H7N9禽流感病毒、埃博拉病毒等所致新發、突發傳染病開展了應急檢測和研究工作。
霍細香告訴記者,今年1月初,衛生檢驗檢測研究所開始參與到新型冠狀病毒的研究工作中,協助上級部門查明原因,根據要求,在P3實驗室對送樣的樣品進行分裝,第一時間送至國家級實驗室以查明病原,最終,國家專家組認為,本次不明原因的病毒性肺炎病例的病原體初步判定為新型冠狀病毒。
在對病毒有了進一步了解后,該所分配由P3實驗室進行病毒分離工作,核酸檢測工作則由所內多個P2實驗室承擔,并同步開展新型冠狀病毒分離與全基因組測序工作,這些都為試劑盒的開發進行了良好鋪墊。
抗擊疫情的第二戰場
整整一個月以來,該研究所一直是抗擊疫情的第二戰場,檢測人員的工作,正是和病毒賽跑,病毒在哪些人里感染,通過他們的檢測就能跟蹤到那里。1月中旬開始,研究所擴大了病例篩查范圍,加緊了檢測,直到春節,每天從晚上開始,都需要進行近300例患者樣本的檢測,第二天一早將檢測結果及時上報反饋出去。
進行病毒檢測,需要近距離接觸病毒,工作人員要反復確認防護服、口罩是否穿戴到位,為了杜絕技術上出錯,至少需要3人為一組,同時參與檢測,目前,已有4組同時進行檢測工作,從樣品登記對號,到進行前處理,提取出病毒核酸,再進行基因擴增,得出最終結果,組員保證24小時在崗,在實驗室旁搭起臨時床鋪,吃住都在辦公室。
1月25日后,為滿足疫情防控需要,武漢多家醫院、市疾控中心、區疾控中心開展新型冠狀病毒核酸檢測,霍細香認為,檢測機構“擴面提速”,可以更好地滿足患者及防控工作需要,為疾病的診斷和治療提供依據。下一步,省疾控中心還將加大對省內不同地域、不同時間的病例樣本進行病毒的分離工作、基因測序,以掌握新型冠狀病毒的病原學、基因的動態變化。